A Millenáris Tudományos Kulturális Alapítvány közérdekű célja egy olyan, a Millenáris Parkban a jövőt bemutató tudományos, kulturális és oktatási központ létrehozása, amely egyben családbarát, interaktív közösségi tér is. Az Alapítvány célkitűzései közé tartozik, hogy a tanulni és szórakozni vágyók egyaránt megtalálják az érdeklődési körüknek megfelelő olyan programokat, amelyek a nemzeti és a nemzetközi együttműködést jelképező, Európa társadalmi, kulturális és életmódbeli értékein, a tudományos, technikai fejlesztésen és az információs társadalom eredményein alapulnak. Hozzájárul a színházi kulturális élet működéséhez, és abban aktívan részt vesz. Az Alapítvány közfeladata a Millenáris Nonprofit Kft. és a Thália Színház Nonprofit Kft., illetve a közfeladat-ellátás eszközét képező, az Alapítvány közvetlen vagy közvetett tulajdonában álló más jogi személy fenntartása és működésének biztosítása is.  

Az Alapítvány ügyvezető szerve a Kuratórium, amelynek tagjai az Alapítvány vezető tisztségviselői. Az Alapítvány alapítója a Magyar Állam, amely az Alapítvány Alapító okiratában az alapítói jogok teljes körének gyakorlására az Alapítvány Kuratóriumát jelölte ki.